遊戲王的故事，就從打開的「黑暗之門」後展開了

　　武藤遊戲從開玩具店的爺爺武藤雙六手中得到了一個「古埃及千年金字塔」的立體拼圖之後，就專心一意，很想要完成它。因為他聽爺爺說過，只要完成金字塔後，它就可以幫助這個完成拼圖的人實現一個願望，在遊戲的心目中一直有一個願望，那就是想要交到許多的好朋友。雖然這個願望擺在他心中已久，但在這八年來，不管在什麼情況下他都無法拼完成金字塔。而就在八年後的今天，因為自己的好友們遇到危機，而他也身受了重傷。一陣得混亂中，手中的金字塔竟然神奇地完成了。雖然危機解決，但他卻不知道潛伏在他內心中的另一個他卻就此甦醒，在遇到一連串不可解的事情後，他終於瞭解到，原來，他的心中還潛伏著另一個自己，他就是守護黑暗之門的正義使者。


第199話　終極的遊戲
　即將和一干友人前往埃及的遊戲，追問爺爺雙六年輕時，把千年積木帶回來的故事，爺爺告訴他當年是請專業帶路人，所以不記得法老王墓地的所在。
遊戲告訴另外一個自己，不需要顧慮他，應該展開尋找記憶之旅。兩個遊戲互相確認對方的心靈覊絆，可是卻發生了神之卡和千年法器被偸走的事件！！
第200話　貘良了出動了
　黑暗貘良了告訴遊戲，當打開冥府之門時，就可以釋放另一個遊戲的靈魂。
另一方面，貘良了用黑暗的遊戲向海馬設下圏套。同一時間，城之內一行人終於湊齊了旅費，準備和遊戲一起踏上前往埃及的旅程。
第201話　打開的記憶之門
　另一個遊戲在埃及的金字塔的石版上，高擧了三張神之卡後，就展開了進入記憶世界的旅程。當他回復意識時，遊戲已變成古代的埃及王（法老王）。在他旁邊有和海馬及雙六他們貌似的六位神官，他們曾利用千年法器透視寄居在罪人心中的邪惡之物，然後把它們抓出來封在石版裏。
另外，貘良了亦在古代埃及，以盜賊王的身份甦醒過來…。

第202話　盜墓王貘良了來了
第203話　瑪哈特的決心
第204話　死戰！瑪哈特VS貘良了
第205話　藍眼晴的奇莎拉
第206話　千年法器誕生的秘密
第207話　被倒回的時間
第208話　法老王還活著
第209話　死靈村
第210話　盜賊貘良了的死期
第211話　嶄新的舞台
第212話　黑暗大神官
第213話　邪神復活倒數計時
　盜賊獏良了和迪爾邦多復活，並出現在法老王他們面前。而阿克納帝和瑟特卻消失在異空間裏。法老王他們被迪爾邦多攻撃得七零八落。
神官卡利姆和愛絲西以歩歩進迫的魔力為對手，陷於苦戰當中，卡利姆的靈魂數値急劇地減少，而愛絲西的精靈又不擅戰鬥。對法老王忠心耿耿的卡利姆，將最後的力量付託於神官夏達的身上…。

第214話　青眼白龍
　阿克納帝告訴瑟特只要殺了奇莎拉取得青眼白龍的力量就可以成為法老王。瑟特拒絶了阿克納帝的要求，而奇莎拉卻為了保護瑟特而犧牲掉。其後當法老王趕來時，瑟特的心早已被阿克納帝操縱了。法老王和失常了的瑟特展開決鬥。青眼白龍擊敗了黑魔導，正當瑟特想將對手了結的時候，他聽到奇莎拉的聲音…。
另一方面，現實世界裏的遊戲王――黑暗遊戲察覺到自己正是封印佐克的關鍵所在。。

第215話　大邪神佐克復活
　遊戲和貘良了在王墓裏開始決鬥。這是遊戲首次為黑暗遊戲而戰。在新的牌組上，遊戲召喚出沉黙的劍手等迎戰，但是被貘良了陸續派出的騎士和亡靈佔了優勢。遊戲用魔法卡「時間的飛躍」減少損傷，並提升沉黙的劍手的作戰能力反擊。
另一方面，在克雷艾爾那村裏大邪神佐克復活了，並開始襲擊神官團。
第216話　傳説的守護神，艾克索迪亞
第217話　召喚三幻神
第218話　佐克VS青眼究極龍
第219話　在王的名下
第220話　最後的試練
第221話　命運的最後決鬥
第222話　打倒三幻神!!
第223話　強悍的心　温柔的心
第224話　走向光明，畫下句點
　受亞圖姆的「黑魔導」攻撃而弄至筋疲力竭的遊戲在「封印的黃金櫃」之下暗藏了一張卡牌。其後，遊戲使用了今次的關鍵牌――「沉黙的魔術師」並成功地擊破黒魔導。
接著亞圖姆連忙以「死者甦醒」，打算將｢歐西裡斯｣復活過來。
就在這時，遊戲解開了「黃金櫃」的封印，令「死者甦醒」變得無效。而這亦是給亞圖姆的臨別訊息――「死者的靈魂是不許停留在現世的」…。


光碟版本：DVD (DVD-5)
影片級別：普遍級
發音語言：國語
字幕選擇：繁體中文
光碟片數：5片/第199～224話
片長時間：每話約30分鐘
螢幕比例：4:3
影片區碼：3區
產品附件：正版盒裝